Texto para a questão sobre PCR em tempo real:
Na reação em cadeia da polimerase (PCR) tradicional, a análise da região de DNA amplificada ocorre após 30-40 ciclos, e o produto é analisado através da eletroforese.
A vantagem da PCR em tempo real é que o processo pode ser monitorado durante a reação. À extensão da amplificação do DNA pode ser determinada após cada ciclo de PCR.
Vários métodos diferentes foram desenvolvidos para isso. O princípio de uma das técnicas mais populares (reação TaqMan) é descrito no experimento seguinte:
Um tumor foi removido da mama de uma paciente. Os DNAs genômicos foram isolados do tumor e do tecido normal circundante, e a reação de PCR foi realizada usando quantidades idênticas das duas amostras de DNA.
As misturas de reação de PCR continham os seguintes componentes:
• amostras de DNAs genômicos;
• muitas cópias de dois primers especificos para uma região do gene HER2;
• muitas cópias de uma sonda TaqMan, um oligonucleotideo que se liga a uma das cadeias moldes na região flanqueada pelos dois primers. Umcorante fluorescente de reportagem, o fluoróforo, é unido à molécula na extremidade 5', e uma molécula extintora é unida a extremidade 3' da sonda, inibindo a fluorescência do corante;
• Tag polimerase;
• trifosfatos de desoxirribonucleosideos (dATP, dGTP, dCTP, dTTP).
Os gráficos mostram os resultados das amostras À e B da PCR em tempo real realizado em uma paciente com câncer de mama
(A) amostra de células cancerigenas
(B) amostra de células normais.
Por que não houve fluorescência detectável após os primeiros ciclos de PCR?
porque não houve sintese de DNA.
porque a Taq polimerase degradou os primers.
porque a Tag polimerase degradou a sonda TaqMan.
porque o detector de fluorescência não estava sensibilizado o suficiente.
porque os extintores bloquearam todas as moléculas de reportagem do corante.